Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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