Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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