Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms