Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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