Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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TRAF2Q12933 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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TRAF2Q12933 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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