Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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