Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms