Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM3Q08188 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM3Q08188 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM3Q08188 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM3Q08188 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TGM3Q08188 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TGM3Q08188 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms