Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms