Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms