Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms