Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms