Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX2P50458 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX2P50458 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX2P50458 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX2P50458 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX2P50458 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX2P50458 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX2P50458 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX2P50458 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX2P50458 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX2P50458 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX2P50458 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX2P50458 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX2P50458 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX2P50458 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX2P50458 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX2P50458 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX2P50458 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX2P50458 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX2P50458 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX2P50458 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX2P50458 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX2P50458 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX2P50458 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX2P50458 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX2P50458 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX2P50458 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX2P50458 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LHX2P50458 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LHX2P50458 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LHX2P50458 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX2P50458 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX2P50458 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX2P50458 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX2P50458 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX2P50458 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX2P50458 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX2P50458 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX2P50458 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX2P50458 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX2P50458 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX2P50458 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX2P50458 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX2P50458 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX2P50458 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX2P50458 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX2P50458 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX2P50458 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX2P50458 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX2P50458 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX2P50458 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX2P50458 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX2P50458 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX2P50458 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX2P50458 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX2P50458 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX2P50458 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX2P50458 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX2P50458 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX2P50458 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX2P50458 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX2P50458 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX2P50458 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX2P50458 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX2P50458 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX2P50458 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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