Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms