Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTPAP49638 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTPAP49638 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTPAP49638 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTPAP49638 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTPAP49638 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTPAP49638 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTPAP49638 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TTPAP49638 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTPAP49638 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTPAP49638 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTPAP49638 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTPAP49638 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTPAP49638 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTPAP49638 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTPAP49638 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTPAP49638 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTPAP49638 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTPAP49638 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTPAP49638 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTPAP49638 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTPAP49638 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTPAP49638 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTPAP49638 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTPAP49638 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTPAP49638 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTPAP49638 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTPAP49638 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTPAP49638 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTPAP49638 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTPAP49638 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTPAP49638 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTPAP49638 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTPAP49638 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTPAP49638 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TTPAP49638 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTPAP49638 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTPAP49638 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTPAP49638 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TTPAP49638 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTPAP49638 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTPAP49638 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTPAP49638 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TTPAP49638 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTPAP49638 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTPAP49638 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTPAP49638 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTPAP49638 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TTPAP49638 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTPAP49638 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTPAP49638 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTPAP49638 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTPAP49638 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTPAP49638 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTPAP49638 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTPAP49638 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTPAP49638 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTPAP49638 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTPAP49638 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTPAP49638 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTPAP49638 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTPAP49638 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTPAP49638 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTPAP49638 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTPAP49638 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTPAP49638 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTPAP49638 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TTPAP49638 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTPAP49638 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTPAP49638 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTPAP49638 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTPAP49638 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTPAP49638 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTPAP49638 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTPAP49638 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTPAP49638 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTPAP49638 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTPAP49638 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTPAP49638 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTPAP49638 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTPAP49638 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTPAP49638 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTPAP49638 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTPAP49638 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTPAP49638 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTPAP49638 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTPAP49638 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTPAP49638 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTPAP49638 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTPAP49638 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTPAP49638 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTPAP49638 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTPAP49638 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTPAP49638 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTPAP49638 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTPAP49638 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTPAP49638 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTPAP49638 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTPAP49638 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTPAP49638 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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