Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms