Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ME1P48163 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ME1P48163 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ME1P48163 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ME1P48163 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ME1P48163 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ME1P48163 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ME1P48163 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ME1P48163 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ME1P48163 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ME1P48163 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ME1P48163 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ME1P48163 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ME1P48163 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ME1P48163 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ME1P48163 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ME1P48163 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ME1P48163 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ME1P48163 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ME1P48163 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ME1P48163 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ME1P48163 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ME1P48163 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ME1P48163 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ME1P48163 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ME1P48163 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ME1P48163 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ME1P48163 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ME1P48163 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ME1P48163 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ME1P48163 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ME1P48163 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ME1P48163 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ME1P48163 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ME1P48163 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ME1P48163 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ME1P48163 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ME1P48163 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ME1P48163 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ME1P48163 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ME1P48163 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ME1P48163 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ME1P48163 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ME1P48163 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ME1P48163 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ME1P48163 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ME1P48163 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ME1P48163 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ME1P48163 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ME1P48163 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ME1P48163 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME1P48163 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME1P48163 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME1P48163 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME1P48163 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME1P48163 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME1P48163 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME1P48163 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ME1P48163 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME1P48163 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME1P48163 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ME1P48163 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME1P48163 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ME1P48163 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME1P48163 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME1P48163 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME1P48163 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME1P48163 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME1P48163 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME1P48163 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME1P48163 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME1P48163 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME1P48163 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME1P48163 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME1P48163 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME1P48163 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME1P48163 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME1P48163 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME1P48163 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME1P48163 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ME1P48163 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ME1P48163 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ME1P48163 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ME1P48163 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ME1P48163 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ME1P48163 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ME1P48163 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ME1P48163 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ME1P48163 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ME1P48163 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ME1P48163 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ME1P48163 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ME1P48163 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ME1P48163 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ME1P48163 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ME1P48163 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ME1P48163 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ME1P48163 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ME1P48163 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ME1P48163 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms