Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms