Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms