Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA2P42262 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms