Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms