Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GPC1P35052 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPC1P35052 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPC1P35052 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPC1P35052 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPC1P35052 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPC1P35052 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPC1P35052 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPC1P35052 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPC1P35052 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPC1P35052 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPC1P35052 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPC1P35052 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPC1P35052 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPC1P35052 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPC1P35052 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPC1P35052 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPC1P35052 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPC1P35052 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPC1P35052 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPC1P35052 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPC1P35052 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPC1P35052 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPC1P35052 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPC1P35052 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPC1P35052 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPC1P35052 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPC1P35052 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPC1P35052 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPC1P35052 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPC1P35052 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPC1P35052 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPC1P35052 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPC1P35052 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPC1P35052 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPC1P35052 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPC1P35052 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GPC1P35052 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPC1P35052 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPC1P35052 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GPC1P35052 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPC1P35052 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPC1P35052 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPC1P35052 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPC1P35052 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPC1P35052 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPC1P35052 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPC1P35052 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPC1P35052 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPC1P35052 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPC1P35052 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPC1P35052 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPC1P35052 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPC1P35052 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPC1P35052 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPC1P35052 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPC1P35052 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPC1P35052 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPC1P35052 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPC1P35052 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPC1P35052 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPC1P35052 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPC1P35052 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPC1P35052 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPC1P35052 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPC1P35052 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPC1P35052 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPC1P35052 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPC1P35052 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPC1P35052 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPC1P35052 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPC1P35052 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPC1P35052 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPC1P35052 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPC1P35052 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GPC1P35052 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GPC1P35052 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GPC1P35052 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GPC1P35052 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GPC1P35052 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
GPC1P35052 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPC1P35052 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPC1P35052 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPC1P35052 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPC1P35052 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPC1P35052 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPC1P35052 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPC1P35052 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPC1P35052 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPC1P35052 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPC1P35052 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GPC1P35052 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPC1P35052 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPC1P35052 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPC1P35052 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPC1P35052 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPC1P35052 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPC1P35052 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPC1P35052 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPC1P35052 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms