Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MCM5P33992 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MCM5P33992 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCM5P33992 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MCM5P33992 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCM5P33992 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MCM5P33992 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MCM5P33992 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCM5P33992 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MCM5P33992 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
MCM5P33992 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MCM5P33992 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MCM5P33992 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MCM5P33992 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCM5P33992 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCM5P33992 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MCM5P33992 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MCM5P33992 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MCM5P33992 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCM5P33992 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCM5P33992 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MCM5P33992 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MCM5P33992 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCM5P33992 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MCM5P33992 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCM5P33992 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCM5P33992 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCM5P33992 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MCM5P33992 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCM5P33992 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCM5P33992 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCM5P33992 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCM5P33992 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MCM5P33992 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MCM5P33992 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MCM5P33992 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCM5P33992 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCM5P33992 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MCM5P33992 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCM5P33992 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
MCM5P33992 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MCM5P33992 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MCM5P33992 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCM5P33992 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MCM5P33992 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCM5P33992 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MCM5P33992 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MCM5P33992 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCM5P33992 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCM5P33992 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCM5P33992 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCM5P33992 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCM5P33992 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCM5P33992 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCM5P33992 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCM5P33992 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCM5P33992 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCM5P33992 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCM5P33992 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCM5P33992 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCM5P33992 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MCM5P33992 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCM5P33992 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MCM5P33992 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCM5P33992 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MCM5P33992 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCM5P33992 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MCM5P33992 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MCM5P33992 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MCM5P33992 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCM5P33992 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCM5P33992 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCM5P33992 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MCM5P33992 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MCM5P33992 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCM5P33992 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MCM5P33992 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCM5P33992 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCM5P33992 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MCM5P33992 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCM5P33992 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MCM5P33992 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCM5P33992 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCM5P33992 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MCM5P33992 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCM5P33992 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCM5P33992 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCM5P33992 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCM5P33992 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MCM5P33992 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MCM5P33992 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCM5P33992 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCM5P33992 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCM5P33992 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCM5P33992 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MCM5P33992 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCM5P33992 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCM5P33992 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MCM5P33992 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCM5P33992 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms