Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ABCC1P33527 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ABCC1P33527 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCC1P33527 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCC1P33527 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCC1P33527 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCC1P33527 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCC1P33527 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCC1P33527 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms