Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TSPOP30536 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TSPOP30536 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TSPOP30536 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TSPOP30536 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TSPOP30536 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TSPOP30536 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TSPOP30536 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TSPOP30536 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TSPOP30536 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TSPOP30536 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TSPOP30536 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TSPOP30536 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TSPOP30536 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TSPOP30536 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TSPOP30536 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TSPOP30536 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TSPOP30536 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TSPOP30536 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TSPOP30536 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TSPOP30536 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TSPOP30536 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TSPOP30536 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TSPOP30536 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TSPOP30536 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TSPOP30536 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TSPOP30536 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TSPOP30536 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TSPOP30536 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TSPOP30536 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TSPOP30536 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TSPOP30536 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TSPOP30536 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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