Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMBRP28336 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMBRP28336 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMBRP28336 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMBRP28336 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMBRP28336 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMBRP28336 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMBRP28336 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMBRP28336 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMBRP28336 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMBRP28336 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMBRP28336 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMBRP28336 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NMBRP28336 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMBRP28336 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NMBRP28336 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMBRP28336 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMBRP28336 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMBRP28336 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMBRP28336 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMBRP28336 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMBRP28336 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NMBRP28336 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMBRP28336 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMBRP28336 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMBRP28336 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMBRP28336 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMBRP28336 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMBRP28336 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMBRP28336 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMBRP28336 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMBRP28336 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMBRP28336 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMBRP28336 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NMBRP28336 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMBRP28336 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMBRP28336 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMBRP28336 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NMBRP28336 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMBRP28336 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMBRP28336 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NMBRP28336 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMBRP28336 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMBRP28336 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMBRP28336 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMBRP28336 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMBRP28336 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMBRP28336 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMBRP28336 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMBRP28336 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMBRP28336 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMBRP28336 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMBRP28336 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMBRP28336 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMBRP28336 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMBRP28336 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMBRP28336 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMBRP28336 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMBRP28336 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMBRP28336 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NMBRP28336 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMBRP28336 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMBRP28336 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMBRP28336 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMBRP28336 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NMBRP28336 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMBRP28336 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMBRP28336 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMBRP28336 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NMBRP28336 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMBRP28336 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NMBRP28336 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMBRP28336 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMBRP28336 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMBRP28336 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NMBRP28336 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMBRP28336 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMBRP28336 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NMBRP28336 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMBRP28336 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMBRP28336 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMBRP28336 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMBRP28336 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMBRP28336 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMBRP28336 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMBRP28336 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMBRP28336 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMBRP28336 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMBRP28336 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMBRP28336 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMBRP28336 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMBRP28336 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMBRP28336 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMBRP28336 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMBRP28336 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMBRP28336 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NMBRP28336 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMBRP28336 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NMBRP28336 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMBRP28336 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms