Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX2P28328 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX2P28328 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX2P28328 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX2P28328 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX2P28328 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX2P28328 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX2P28328 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX2P28328 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX2P28328 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX2P28328 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX2P28328 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX2P28328 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX2P28328 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX2P28328 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX2P28328 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX2P28328 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX2P28328 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX2P28328 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX2P28328 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX2P28328 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX2P28328 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX2P28328 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX2P28328 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX2P28328 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX2P28328 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX2P28328 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX2P28328 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX2P28328 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX2P28328 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX2P28328 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX2P28328 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX2P28328 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX2P28328 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX2P28328 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX2P28328 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX2P28328 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX2P28328 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX2P28328 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX2P28328 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX2P28328 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX2P28328 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX2P28328 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX2P28328 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX2P28328 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX2P28328 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX2P28328 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX2P28328 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX2P28328 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX2P28328 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX2P28328 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX2P28328 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX2P28328 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX2P28328 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX2P28328 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX2P28328 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX2P28328 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX2P28328 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX2P28328 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX2P28328 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX2P28328 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX2P28328 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX2P28328 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX2P28328 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX2P28328 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX2P28328 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX2P28328 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX2P28328 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX2P28328 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX2P28328 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX2P28328 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX2P28328 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX2P28328 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX2P28328 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX2P28328 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX2P28328 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX2P28328 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX2P28328 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX2P28328 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX2P28328 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX2P28328 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX2P28328 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX2P28328 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX2P28328 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX2P28328 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX2P28328 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX2P28328 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX2P28328 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX2P28328 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX2P28328 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX2P28328 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX2P28328 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX2P28328 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX2P28328 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX2P28328 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX2P28328 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX2P28328 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX2P28328 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX2P28328 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX2P28328 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms