Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms