Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms