Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms