Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms