Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BMP3P12645 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BMP3P12645 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BMP3P12645 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BMP3P12645 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BMP3P12645 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BMP3P12645 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BMP3P12645 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BMP3P12645 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BMP3P12645 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BMP3P12645 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BMP3P12645 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BMP3P12645 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BMP3P12645 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BMP3P12645 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BMP3P12645 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BMP3P12645 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BMP3P12645 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BMP3P12645 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BMP3P12645 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BMP3P12645 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BMP3P12645 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BMP3P12645 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BMP3P12645 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BMP3P12645 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BMP3P12645 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BMP3P12645 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BMP3P12645 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BMP3P12645 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BMP3P12645 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BMP3P12645 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BMP3P12645 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BMP3P12645 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BMP3P12645 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BMP3P12645 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BMP3P12645 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BMP3P12645 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BMP3P12645 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BMP3P12645 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BMP3P12645 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BMP3P12645 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BMP3P12645 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BMP3P12645 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BMP3P12645 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BMP3P12645 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BMP3P12645 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BMP3P12645 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BMP3P12645 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BMP3P12645 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BMP3P12645 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BMP3P12645 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BMP3P12645 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BMP3P12645 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BMP3P12645 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BMP3P12645 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BMP3P12645 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BMP3P12645 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BMP3P12645 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BMP3P12645 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BMP3P12645 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BMP3P12645 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BMP3P12645 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BMP3P12645 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BMP3P12645 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BMP3P12645 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BMP3P12645 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BMP3P12645 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BMP3P12645 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BMP3P12645 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BMP3P12645 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BMP3P12645 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BMP3P12645 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BMP3P12645 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BMP3P12645 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BMP3P12645 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BMP3P12645 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BMP3P12645 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BMP3P12645 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BMP3P12645 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BMP3P12645 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BMP3P12645 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BMP3P12645 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BMP3P12645 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BMP3P12645 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BMP3P12645 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BMP3P12645 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BMP3P12645 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BMP3P12645 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BMP3P12645 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BMP3P12645 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BMP3P12645 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BMP3P12645 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BMP3P12645 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
BMP3P12645 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BMP3P12645 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BMP3P12645 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BMP3P12645 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BMP3P12645 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BMP3P12645 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BMP3P12645 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms