Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX6A1P12074 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms