Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RGPD1P0DJD0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms