Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms