Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NGFRP08138 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NGFRP08138 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NGFRP08138 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NGFRP08138 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NGFRP08138 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NGFRP08138 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NGFRP08138 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NGFRP08138 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NGFRP08138 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NGFRP08138 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NGFRP08138 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NGFRP08138 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NGFRP08138 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NGFRP08138 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NGFRP08138 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NGFRP08138 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NGFRP08138 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NGFRP08138 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NGFRP08138 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NGFRP08138 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NGFRP08138 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NGFRP08138 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NGFRP08138 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NGFRP08138 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NGFRP08138 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NGFRP08138 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NGFRP08138 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NGFRP08138 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NGFRP08138 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NGFRP08138 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NGFRP08138 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NGFRP08138 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NGFRP08138 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NGFRP08138 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NGFRP08138 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NGFRP08138 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NGFRP08138 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NGFRP08138 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NGFRP08138 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NGFRP08138 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NGFRP08138 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NGFRP08138 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NGFRP08138 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NGFRP08138 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NGFRP08138 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NGFRP08138 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NGFRP08138 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NGFRP08138 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NGFRP08138 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NGFRP08138 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NGFRP08138 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NGFRP08138 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NGFRP08138 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NGFRP08138 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NGFRP08138 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NGFRP08138 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.9 ms