Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
F13BP05160 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
F13BP05160 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
F13BP05160 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
F13BP05160 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
F13BP05160 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
F13BP05160 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
F13BP05160 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
F13BP05160 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
F13BP05160 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
F13BP05160 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
F13BP05160 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
F13BP05160 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
F13BP05160 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
F13BP05160 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
F13BP05160 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
F13BP05160 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
F13BP05160 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
F13BP05160 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
F13BP05160 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
F13BP05160 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
F13BP05160 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
F13BP05160 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
F13BP05160 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
F13BP05160 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
F13BP05160 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
F13BP05160 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
F13BP05160 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
F13BP05160 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
F13BP05160 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
F13BP05160 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
F13BP05160 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
F13BP05160 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
F13BP05160 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
F13BP05160 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
F13BP05160 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
F13BP05160 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
F13BP05160 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
F13BP05160 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
F13BP05160 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
F13BP05160 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
F13BP05160 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
F13BP05160 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
F13BP05160 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
F13BP05160 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
F13BP05160 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
F13BP05160 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
F13BP05160 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
F13BP05160 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
F13BP05160 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
F13BP05160 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
F13BP05160 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
F13BP05160 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
F13BP05160 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
F13BP05160 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
F13BP05160 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
F13BP05160 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
F13BP05160 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
F13BP05160 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
F13BP05160 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
F13BP05160 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
F13BP05160 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
F13BP05160 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
F13BP05160 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
F13BP05160 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F13BP05160 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
F13BP05160 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F13BP05160 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F13BP05160 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F13BP05160 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
F13BP05160 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F13BP05160 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F13BP05160 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F13BP05160 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F13BP05160 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F13BP05160 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F13BP05160 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
F13BP05160 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F13BP05160 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F13BP05160 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
F13BP05160 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F13BP05160 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
F13BP05160 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
F13BP05160 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F13BP05160 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F13BP05160 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F13BP05160 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
F13BP05160 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F13BP05160 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
F13BP05160 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F13BP05160 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
F13BP05160 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
F13BP05160 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
F13BP05160 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
F13BP05160 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F13BP05160 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
F13BP05160 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
F13BP05160 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
F13BP05160 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F13BP05160 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms