Protein–RNA interactions for Protein: O95989

NUDT3, Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT3O95989 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUDT3O95989 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms