Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CBX7O95931 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CBX7O95931 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX7O95931 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX7O95931 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX7O95931 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX7O95931 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX7O95931 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX7O95931 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX7O95931 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX7O95931 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX7O95931 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX7O95931 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX7O95931 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX7O95931 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX7O95931 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX7O95931 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX7O95931 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX7O95931 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX7O95931 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX7O95931 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX7O95931 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX7O95931 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms