Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN9O95484 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms