Protein–RNA interactions for Protein: O75312

ZPR1, Zinc finger protein ZPR1, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZPR1O75312 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZPR1O75312 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZPR1O75312 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZPR1O75312 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZPR1O75312 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZPR1O75312 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZPR1O75312 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZPR1O75312 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZPR1O75312 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZPR1O75312 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZPR1O75312 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZPR1O75312 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZPR1O75312 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZPR1O75312 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZPR1O75312 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZPR1O75312 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZPR1O75312 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZPR1O75312 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms