Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN2O60636 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms