Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms