Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1GO43497 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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