Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRXO43186 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRXO43186 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRXO43186 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRXO43186 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRXO43186 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRXO43186 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRXO43186 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRXO43186 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRXO43186 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRXO43186 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CRXO43186 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CRXO43186 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRXO43186 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRXO43186 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRXO43186 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRXO43186 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRXO43186 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRXO43186 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CRXO43186 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRXO43186 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRXO43186 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRXO43186 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRXO43186 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRXO43186 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRXO43186 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CRXO43186 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRXO43186 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRXO43186 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRXO43186 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRXO43186 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRXO43186 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRXO43186 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CRXO43186 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRXO43186 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRXO43186 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CRXO43186 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRXO43186 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRXO43186 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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