Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SYNJ2O15056 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYNJ2O15056 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYNJ2O15056 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYNJ2O15056 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYNJ2O15056 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYNJ2O15056 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.2 ms