Protein–RNA interactions for Protein: O00233

PSMD9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD9O00233 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD9O00233 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD9O00233 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD9O00233 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD9O00233 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD9O00233 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD9O00233 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD9O00233 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD9O00233 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD9O00233 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD9O00233 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD9O00233 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD9O00233 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD9O00233 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD9O00233 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD9O00233 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD9O00233 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD9O00233 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD9O00233 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD9O00233 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD9O00233 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD9O00233 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD9O00233 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD9O00233 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD9O00233 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD9O00233 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms