Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms