Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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