Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms